Patogenicidade de isolados de Escherichia coli provenientes de fezes de galinhas ou bovinos e resistência a antibióticos

Abstract

Escherichia coli é uma bactéria Gram negativa que pertence à família Enterobacteriaceae. Faz parte da microbiota intestinal do homem e animais, podendo ser encontrada em fezes. Possui uma capacidade de vida livre, apresentando-se com características bastantes distintas. De acordo com o seu grupo filogenético (A,B1, B2, C, E,D,F) e a sua patogenicidade (EPEC, EIEC, ETEC, EHEC/STEC e EAEC) poderá ou não causar danos ao hospedeiro. A principal diferença entre os isolados patogénicos e comensais de E. coli está associado à presença de elementos genéticos específicos (cromossomais ou extracromossomais). Para o combate destas infeções, são utilizados diferentes antibioticos. Contudo a eficácia dos agentes antibacterianos foi rapidamente superada pela capacidade que as bactérias têm de se opor à sua acção, principalmente pelo uso abusivo e intensivo dos mesmos, favorecendo a sua seleção. Este trabalho foi desenvolvido no Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária e teve por objetivo inicial caracterizar fenotipicamente e genotipicamente isolados de E. coli provenientes de fezes de bovinos e de galinhas, verificando a sua diversidade genética pela determinação e identificação dos seus grupos filogenéticos, avaliar se pertenciam a um dos seis patotipos diarreicogénicos e finalmente verificar a resistência aos diferentes antimicrobianos selecionados e pesquisar a existência de genes de resistência associados às β-lactamases de largo espetro. Dos 140 isolados em estudo provenientes de fezes de bovino e de fezes de galinhas, o grupo filognético predominantemente identificado foi B1 para ambos os grupos de animais. Ao nível dos genes de patogenicidade DEC em estudo, em nenhum dos isolados foram identificados. Quanto à exibição de resistência a antimicrobianos verificou-se que os isolados de galinhas apresentaram percentagens de resistência superiores aos isolados de bovinos. Quase metade dos isolados em estudo, apresentaram-se multirresistentes, havendo diferenças quando se analisou os isolados provenientes de bovinos com uma margem de 20% e isolados provenientes de galinhas com uma margem de 55%. Para ambos os grupos de animais foram detetados genes de resistência β-lactamases de largo espetro.

Escherichia coli is a Gram-negative bacterium that belongs to the Enterobacteriaceae family. It is part of the intestinal microbiota of man and animals, and can be found in faeces. According to its phylogenetic group (A, B1, B2, C, E, D, F) and its pathogenicity type (EPEC, EIEC, ETEC, EHEC / STEC and EAEC) it may cause injury to the host. The main difference between pathogenic and commensal E. coli is associated with the presence of specific genetic elements - chromosomal or extrachromosomal. To combat infections of the pathogen, different antibiotics are used. However, the effectiveness of antibacterial agents was quickly overcome by the ability of bacteria to oppose their action. This work was developed at the National Institute of Agrarian and Veterinary Research and its initial goal was to characterize phenotypically and genotypically the isolates of E. coli from faeces of cattle and chickens, verifying their genetic diversity by determining and identifying their phylogenetic groups, assess whether they belonged to one of the six decotypes diarrhogenic and finally check the resistance to the different selected antimicrobials and research the existence of resistance genes associated with Extended spectrum beta-lactamases. This work was developed at the National Institute of Agrarian and Veterinary Research and its initial objective was to characterize phenotypically and genotypically isolates of E. coli from cattle and chicken faeces origin, verifying their genetic diversity by determining and identifying their phylogenetic groups, assessing whether they belonged to one of the six diarrhogenic pathotypes and finally to assess the resistance to the different selected antimicrobials and to investigate the existence of resistance genes associated with extended-spectrum β-lactamases. Of the 140 isolates under study from bovine and chicken faeces, the predominantly identified phylogenetic group was B1 for both groups of animals. Level of DEC pathogenicity genes under study, in none of the identified cases. As for the display of resistance, it was found that chickens had higher percentages than cattle. Almost half of the gains under study, if separated multi-resistant, with differences when analysing the gains obtained from cattle with a margin of 20% and obtaining proof from chickens with a margin of 55%. ESBL resistance genes were detected for both groups of animals.