A novel system for managing OpenEHR structures

Abstract

The term e-Health has been increasingly used in research projects in the health industry. This concept encompasses the development and application of software and hardware solutions for the collection, storage, manipulation, and communication of data in an efficient way, with an objective of continuously improving the provision of health care. The development of Health Information Systems has increasingly lacked the establishment of high levels of interoperability in its semantic, syntactic, and technical aspects. The development of systems that allow promoting interoperability between HIS within the same institution or even between HIS from different institutions is on the global agenda as a common concern for all countries. The use of globally recognized standards has been increasingly common, ensuring that both the information structure and its meaning remain intact, regardless of the flow they follow. Thus arises the motivation to develop a system that contributes to the continuous improvement of interoperability in health, through the use of the openEHR standard. The following dissertation presents a novel way to handle clinical data by creating an artifact enabling the conversion of openEHR standardized data into a JSON object. The web application showcases a new way for a user to check for openEHR data while the API can be utilized by developers to work with openEHR data in a more accessible and supported manner with other programming tools. To carry out the work a thorough examination of web development tools to build both the backend and frontend of the app was essential, as well as coming up with the most accurate regex expressions that are able to extract data from openEHR files. The research and engineering effort put through the project was successful in showcasing this novel approach implementing yet another tool to help out healthcare professionals and biomedical software engineers.

O termo e-Health tem sido cada vez mais utilizado em projetos de pesquisa na área da saúde. Este conceito engloba o desenvolvimento e aplicação de soluções de software e hardware para recolha, armazenamento, manipulação e comunicação de dados de forma eficiente, com o objetivo de melhorar continuamente a prestação de cuidados de saúde. O desenvolvimento dos Sistemas de Informação em Saúde (SIS) tem falta de estabelecimento de elevados níveis de interoperabilidade nas suas vertentes semântica, sintática e técnica. O desenvolvimento de sistemas que permitam promover a interoperabilidade entre SIS dentro da mesma instituição ou mesmo entre SIS de diferentes instituições é uma preocupação comum a todos os países. A utilização de padrões mundialmente reconhecidos tem sido cada vez mais comum, garantindo que tanto a estrutura da informação assim como o seu significado permaneçam intactos, independentemente do fluxo que seguem. Surge assim a motivação para desenvolver um sistema que contribua para a melhoria contínua da interoperabilidade na saúde, através da utilização da norma openEHR. Esta dissertação apresenta uma nova forma de tratar dados clínicos criando um artefato que permite a conversão de dados padronizados openEHR em um objeto JSON. A aplicação Web apresenta uma nova maneira de um usuário verificar dados openEHR enquanto a API pode ser utilizada por desenvolvedores para trabalhar com dados openEHR de uma maneira mais acessível e compatível com outras ferramentas de programação. Para realizar o trabalho, foi essencial uma análise das ferramentas de desenvolvimento web para construir o backend e o frontend do aplicativo, além de encontrar as expressões regex mais precisas que são capazes de extrair dados de arquivos openEHR. O esforço de pesquisa e engenharia realizado no projeto foi bem-sucedido em mostrar esta nova abordagem, implementando mais uma ferramenta para ajudar profissionais de saúde e engenheiros de software biomédico.