Estudo da prevalência das doenças lisossomais em Portugal

Abstract

As doenças lisossomais de sobrecarga (DLSs) são um grupo de doenças hereditárias do metabolismo que resultam de acumulação de substratos no lisossoma. Realizaram-se estudos de prevalência para os casos estudados, num dos laboratórios do Centro de Genética Médica Jacinto Magalhães, CGMJM, e a estimação de intervalos de referência para probandos. Pretendeu-se estabelecer estimativas de prevalências de um grupo de patologias, para o intervalo de atividade do laboratório e para o intervalo relativo ao período de nascimento dos casos diagnosticados. Adicionalmente, estabeleceu-se intervalos de referência para um parâmetro analítico sujeito a critérios de seleção como, sexo e qualidade da amostra. Esta estimação possui por base a necessidade de atualização dos valores do laboratório, de forma a que o diagnóstico possa ir de encontro à realidade da sua população. Foram estabelecidas comparações entre proporção binomial e taxa, entre vários métodos existentes de estimação intervalar como, Clopper-Pearson, Wald, Agresti-Coull, Wilson, mid- P, Jeffreys e para uma taxa, com base na distribuição Binomal e Poisson. Para estimação dos intervalos de referência, foram seguidas as recomendações IFCC (1984a,1984b) e CLSI (2000). Na identificação de outliers recorreu-se ao método de Tukey com análise gráfica do boxplot e ao método de Horn. No final, foi estimado pelo método robusto com 95% de confiança, o intervalo de referência para os probandos doentes, e pelo método não paramétrico com 95% de confiança, o intervalo de referência para os probandos normais. O método de estimação intervalar determinado como adequado para este estudo é o método de Wilson. A decisão teve por base investigações, tais como Agresti & Coull (1998), Brown et al. (2001), Brown et al. (2002), Cepeda-Cuervo et al. (2008) entre outras, que comparavam todos os métodos referidos anteriormente, de forma exaustiva. Na estimação dos intervalos de referência para um parâmetro analítico, os outliers foram identificados com base o método de Tukey, e pode-se afirmar que ambos os intervalos estimados são representativos dos indivíduos do laboratório.

Lysosomal storage disorders (LSDs) are a group of inherited metabolic diseases that result from accumulation of substrates in the lysosome. Prevalence studies were performed in one of the laboratories of the Centro de Genética Médica Jacinto Magalhães, CGMJM, and the estimation of reference intervals for probands. It was intended to establish prevalences estimates of a group of pathologies, for the laboratory activity interval and for the interval relative to the period of birth of the diagnosed cases. In addition, reference intervals were established for an analytical parameter subject to selection criteria such as sex and sample quality. This estimation is based on the need to update the laboratory values, so that the diagnosis can meet the reality of its population. Comparisons between binomial proportion and rate were established between several existing interval estimation methods, such as Clopper-Pearson, Wald, Agresti-Coull, Wilson, mid-P, Jeffreys, and for a rate, based on Binomal and Poisson distributions. For the estimation of reference intervals were followed the IFCC (1984a, 1984b) and CLSI (2000) recommendations. For outlier’s identification were used the Tukey method with graphical analysis of the boxplot and the Horn method. In the end, it was estimated by the robust method with 95% confidence, the reference interval for probands with disease, and by the non-parametric method with 95% confidence, the reference interval for probands without disease. The method for interval estimation determined as appropriate for this study is the Wilson method. The decision was based on investigations such as Agresti & Coull (1998), Brown et al. (2001), Brown et al. (2002), Cepeda-Cuervo et al. (2008), among others, that compared all the above methods exhaustively. In reference intervals estimation for an analytical parameter, outliers were identified based on the Tukey method, and both estimated intervals are representative of the laboratory individuals.